Caracterización por Ardrea de microorganismos acidófilos aislados en minas de oro de Marmato, Colombia

Ardrea characterisation of acidophilic micro-organisms isolated from gold mines in Marmato, Colombia

La bio-oxidación de minerales mejora la recuperación de metales valiosos y disminuye el impacto negativo causado por los subproductos de las operaciones mineras, pero las interacciones de los microorganismos involucrados son poco conocidas. Con el objeto de avanzar en el estudio de interacciones microbianas de bacterias acidófilas nativas en cultivos mixtos, en este trabajo se utilizó la siembra en medio sólido doble capa y el análisis de enzimas de restricción del ADN ribosomal amplificado (Ardrea) con las enzimas Eco72I, Eco24I, XcmI y BsaAI para caracterizar cuatro aislados tomados de minas de oro de Marmato, Colombia. Los aislados que oxidan hierro y azufre exhibieron patrones de restricción del gen ARNr 16S compatibles con los reportados para Acidithiobacillus ferrooxidans, aunque uno de ellos mostró una morfología de colonia que no ha sido descrita para esta especie; el aislado que oxida azufre mostró un patrón que coincide con el análisis teórico realizado sobre secuencias para Acidithiobacillus thiooxidans incluidas en bases de datos primarias. La técnica Ardrea permitió diferenciar entre At.ferrooxidans y At.thiooxidans, y verificar si la identidad de los aislados correspondía con sus características fisiológicas y la morfología de sus colonias.

Mineral bio-oxidation improves the extraction of valuable metals and also decreases the impact caused by mining waste; however, the interactions between the micro-organisms so involved are little known. Double-layer solid culture media techniques and amplified ribosomal DNA restriction enzyme analysis (Ardrea), using Eco72I, Eco24I, XcmI and BsaAI enzymes, were used for characterising four micro-organisms isolated from gold mines located in Marmato, Colombia. This work was aimed at better understanding of native acidophilic micro-organisms’ microbial interactions in mixed cultures. Iron and sulphur oxidising isolates revealed similar restriction patterns to those previously reported for Acidithiobacillus ferrooxidans; however, one of them exhibited different colony morphology compared to previously reported morphology. The iron non-oxidising isolate presented a restriction pattern agreeing with theoretical analysis of Acidithiobacillus thiooxidans database sequences. ARDREA proved to be a viable technique for differentiating between At. ferrooxidans and At. thiooxidans; in turn, it enabled checking isolates’ identity with their physiological traits and colony morphology.