Publicado

2007-07-01

Diseño de un modelo bioinformática para la detección, identificación y clasificación de genes codificantes de B-lactamasas, como herramienta para el cruce de datos moleculares con datos clínicos

Bioinformatics model design for the detection, identification and classification of ï¢-lactamases genes, as a tool for crossing molecular data with clinical data

Palabras clave:

Bioinformática, beta-lactamasas, identificación, sistema de información. (es)
Bioinformatics, beta-lactamases, classification, information system (en)

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Autores/as

  • Emiliano Barreto Hernandez
  • María Teresa Reguero Reza

El seguimiento epidemiológico y farmacológico de la resistencia a antibióticos b-lactámicos mediada por la presencia de b-lactamasas requiere identificación precisa, lo cual es posible mediante la secuencia del gen, que es identificado con herramientas bioinformáticas que se incorporan a sistemas de información. Para implementar un prototipo de sistema de información que permite clasificar secuencias de genes de b-lactamasas producidas por microorganismos resistentes aislados en hospitales y realizar su cruce con los datos clínicos, se obtuvieron las secuencias de b-lactamasas reportadas a escala mundial en la base de datos Uniprot utilizando el sistema de recuperación de secuencias (SRS) del Instituto Europeo de Bioinformática (EBI), se diseñó un sistema de datos moleculares y clínicos usando “Unified Modeling Language†(UML), y se generó un modelo implementado en un servidor con sistema operativo UNIX, gestor de bases de datos MySQL para realizar la creación de la base de datos y lenguajes de programación Perl y PHP para implementar programas y cruzar datos. El sistema de información BLA_ID_CLINIC permite hacer el cruce de datos moleculares y clínicos, de tal forma que se puedan identificar las b-lactamasas de microorganismos resistentes en hospitales y hacer un seguimiento del manejo de los antibióticos y el comportamiento epidemiológico, modelo bioinformático permanentemente actualizado, disponible a través de Internet en http://bioinf.ibun.unal.edu.oc/BLA_ID_CLINIC.

The epidemiology and pharmacology of the b-lactamic antibiotics resistance at hospital level mediate by the presence of b-lactamasas requires of their precise identification, possible through the gene sequence that can be identified using bioinformatics tools and incorporated into the information systems. Prototype of information system BAL_ID_CLINIC was implemented for allowing genes sequences classification of b-lactamases produced by isolated resistant microorganisms in hospitals and their crossing with the clinical data. The information system was development using Unified Modeling Language UML and the prototype was implemented in an Unix server, using MySQL management system for data base building and Perl and PHP as a programming languages for writing scripts that obtain cross relationship between the different kind of data inside the system and the result report presentation. BLA_ID_CLINIC allows crossing of molecular and clinical data. It can identify b-lactamasas produced by resistant microorganisms isolated in hospital patients and can give information related with the antibiotics management and the epidemiologic behavior. The bioinformatics prototype BLA_ID_CLINIC is permanently updated and available through Internet in http://bioinf.ibun.unal.edu.oc/BLA_ID_CLINIC.

Cómo citar

APA

Barreto Hernandez, E. y Reguero Reza, M. T. (2007). Diseño de un modelo bioinformática para la detección, identificación y clasificación de genes codificantes de B-lactamasas, como herramienta para el cruce de datos moleculares con datos clínicos. Revista Colombiana de Ciencias Químico-Farmacéuticas, 36(2). https://revistas.unal.edu.co/index.php/rccquifa/article/view/1569

ACM

[1]
Barreto Hernandez, E. y Reguero Reza, M.T. 2007. Diseño de un modelo bioinformática para la detección, identificación y clasificación de genes codificantes de B-lactamasas, como herramienta para el cruce de datos moleculares con datos clínicos. Revista Colombiana de Ciencias Químico-Farmacéuticas. 36, 2 (jul. 2007).

ACS

(1)
Barreto Hernandez, E.; Reguero Reza, M. T. Diseño de un modelo bioinformática para la detección, identificación y clasificación de genes codificantes de B-lactamasas, como herramienta para el cruce de datos moleculares con datos clínicos. Rev. Colomb. Cienc. Quím. Farm. 2007, 36.

ABNT

BARRETO HERNANDEZ, E.; REGUERO REZA, M. T. Diseño de un modelo bioinformática para la detección, identificación y clasificación de genes codificantes de B-lactamasas, como herramienta para el cruce de datos moleculares con datos clínicos. Revista Colombiana de Ciencias Químico-Farmacéuticas, [S. l.], v. 36, n. 2, 2007. Disponível em: https://revistas.unal.edu.co/index.php/rccquifa/article/view/1569. Acesso em: 29 mar. 2024.

Chicago

Barreto Hernandez, Emiliano, y María Teresa Reguero Reza. 2007. «Diseño de un modelo bioinformática para la detección, identificación y clasificación de genes codificantes de B-lactamasas, como herramienta para el cruce de datos moleculares con datos clínicos». Revista Colombiana De Ciencias Químico-Farmacéuticas 36 (2). https://revistas.unal.edu.co/index.php/rccquifa/article/view/1569.

Harvard

Barreto Hernandez, E. y Reguero Reza, M. T. (2007) «Diseño de un modelo bioinformática para la detección, identificación y clasificación de genes codificantes de B-lactamasas, como herramienta para el cruce de datos moleculares con datos clínicos», Revista Colombiana de Ciencias Químico-Farmacéuticas, 36(2). Disponible en: https://revistas.unal.edu.co/index.php/rccquifa/article/view/1569 (Accedido: 29 marzo 2024).

IEEE

[1]
E. Barreto Hernandez y M. T. Reguero Reza, «Diseño de un modelo bioinformática para la detección, identificación y clasificación de genes codificantes de B-lactamasas, como herramienta para el cruce de datos moleculares con datos clínicos», Rev. Colomb. Cienc. Quím. Farm., vol. 36, n.º 2, jul. 2007.

MLA

Barreto Hernandez, E., y M. T. Reguero Reza. «Diseño de un modelo bioinformática para la detección, identificación y clasificación de genes codificantes de B-lactamasas, como herramienta para el cruce de datos moleculares con datos clínicos». Revista Colombiana de Ciencias Químico-Farmacéuticas, vol. 36, n.º 2, julio de 2007, https://revistas.unal.edu.co/index.php/rccquifa/article/view/1569.

Turabian

Barreto Hernandez, Emiliano, y María Teresa Reguero Reza. «Diseño de un modelo bioinformática para la detección, identificación y clasificación de genes codificantes de B-lactamasas, como herramienta para el cruce de datos moleculares con datos clínicos». Revista Colombiana de Ciencias Químico-Farmacéuticas 36, no. 2 (julio 1, 2007). Accedido marzo 29, 2024. https://revistas.unal.edu.co/index.php/rccquifa/article/view/1569.

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1.
Barreto Hernandez E, Reguero Reza MT. Diseño de un modelo bioinformática para la detección, identificación y clasificación de genes codificantes de B-lactamasas, como herramienta para el cruce de datos moleculares con datos clínicos. Rev. Colomb. Cienc. Quím. Farm. [Internet]. 1 de julio de 2007 [citado 29 de marzo de 2024];36(2). Disponible en: https://revistas.unal.edu.co/index.php/rccquifa/article/view/1569

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