Epidemiología molecular de la tuberculosis en Bogotá en aislados clínicos obtenidos durante 11 años
Molecular epidemiology of tuberculosis in Bogotá in clinical isolates obtained over an 11-year period
Palavras-chave:
Tuberculosis, transmisión, epidemiología molecular, dermatoglifia del ADN, polimorfismo de longitud del fragmento de restricción del ADN, tuberculosis farmacorresistente (es)Tuberculosis, transmission, molecular epidemiology, DNA fingerprinting, restriction fragment length polymorphism, multidrug-resistant tuberculosis (en)
Downloads
Objetivo. Tipificar molecularmente aislados clínicos de Mycobacterium tuberculosis obtenidas en Bogotá entre los años 1995 a 2006, mediante la técnica RFLP-IS6110 para establecer las relaciones filogenéticas existentes entre ellos y determinar casos debidos a infección reciente (casos agrupados) Vs reactivaciones endógenas (patrones únicos).
Métodos. Se realizó un estudio retrospectivo, en el que se incluyeron 137 aislados clínicos pertenecientes al complejo Mycobacterium tuberculosis, obtenidos en Bogotá entre los años 1995 a 2006. Las variables estudiadas para cada paciente fueron: sexo, edad, confección con el Virus de la Inmunodeficiencia Humana, habitante en situación de calle, resultado de la baciloscopia, fecha del cultivo. Los aislados fueron identificados fenotípicamente y confirmados genotípicamente mediante el método molecular PRA y evaluados para sensibilidad a fármacos antituberculosos de primera línea utilizando el método simplificado de las proporciones múltiples. La genotipificación se realizó empleando el método de referencia RFLP-IS6110 (Polimorfismo en la Longitud de los Fragmentos de restricción).
Resultados. Todos los aislados fueron confirmados como pertenecientes al complejo M. tuberculosis, mostrando la identificación fenotípica una concordancia del 100 % con la identificación genotípica. La monorresistencia encontrada fue de 9,4 %, y la MDR (resistencia a Rifampicina e Isoniazida) fue 2,9 %. La genotipificación se realizó a 129 aislados, de los cuales 96 (74 %) mostraron diferentes patrones RFLP-IS6110 y 35 aislados (26 %) estuvieron agrupados en 17 clusters conformados por 2 a 4 aislados. La relación epidemiológica entre los pacientes no pudo ser establecida en la mayoría de los casos. De las variables estudiadas solamente el estado de coinfección con VIH fue un predictor significativo para el agrupamiento (p<0.05).
Conclusión. Los resultados de nuestro estudio muestran un alto porcentaje de genotipos con patrones RFLP-IS6110 únicos, lo que sugiere gran variabilidad genética entre los aislados de M. tuberculosis circulantes en Bogotá, indicando que la mayoría de los casos de tuberculosis en el estudio pueden ser atribuibles a reactivaciones endógenas.
Objective. Characterising clinical Mycobacterium tuberculosis isolates obtained from 1995 to 2006 in Bogotá, Colombia, using standardised IS6110-based RFLP typing for determining phylogenetic relationships. Calculating cases due to recent infection (grouped cases) cf endogenous reactivation (single patterns).
Methods. This retrospective study characterised 137 clinical Mycobacterium tuberculosis isolates obtained in Bogotá from 1995 to 2006. Study variables consisted of gender, age, HIV status, homelessness, Ziehl Neelsen smear result and date of culture. All isolates were freshly identified by phenotypic methods, confirmed by PRA and evaluated for susceptibility to antimicrobial agents according to the proportional method. Mycobacterium tuberculosis cultures were typed by standardised IS6110-based RFLP.
Results. All isolates were confirmed as being M. tuberculosis by phenotypic and genotypic methods. 9,4 % monoresistance and 2,9 % MDR (rifampicin- and isoniazid-resistant) were found. 129 M. tuberculosis isolates were genotyped; 96 (74 %) of them presented unique DNA fingerprints, whilst 35 (26 %) were grouped into 17 clusters consisting of two to four isolates. Direct epidemiological links between patients could not be established in most cases. Only HIV status was a significant predictor of clustering amongst the variables being studied (p<0.05).
Conclusion. The results of our study revealed a high proportion of unique DNA fingerprints, suggesting high genetic variability between M. tuberculosis strains in Bogotá, Colombia, meaning that most cases of TB in this study were attributed to endogenous reactivation.
Referências
WHO Report. Global Tuberculosis Control, Surveillance, Planning, Financing. World Health Organization; 2006
Ministerio de la Protección Social. Dirección general de Salud Pública. Instituto Nacional de Salud. Subdirección de Epidemiología y Laboratorio Nacional de Referencia. Informe quincenal Epidemiológico Nacional. 2006; 11 (6): 88-90.
Murcia MI, Leao SC, Rittaco V, Palenque E, de Oliveira RS, Reniero A, et al. Distribución de patrones PRA en aislamientos clínicos del complejo Mycobacterium avium procedentes de España y Suramérica. Biomédica. 2004; 25: 22-33.
Telenti A, Marchesi F, Balz M, Bally F, Bottger EC and Bodmer T. Rapid Identification of Mycobacteria to Species Level by Polymerase Chain Reaction and Restriction Enzyme Análisis. J. Clin. Microbiol. 1993;31: 175-178.
Drobniewski F, Gibson A, Ruddy M. Evaluation and Utilization as a Public Health Tool of a National Molecular Epidemiological Tuberculosis Outbreak Database within the United Kingdom from 1997 to 2001. J Clin Microbiol. 2003; 41:1861-1868.
Small P, Hopewell P, Singh P, Paz A, Parsonnet J, Ruston D, et al. The Epidemiology of Tuberculosis in San Francisco A Population-Based Study Using Conventional and Molecular Methods. N. Engl. J. Med. 1994; 330: 1703-1709.
Van Embden J, Cave M, Crawford J, Dale J, Eisenach K, Gicquel B, et al. Strain Identification of Mycobacterium tuberculosis by DNA Fingerprinting: Recommendations for a Standarized Methodology. J Clin Microb. 1993; 31:406-409.
Van Soolingen D, Hermans P, de Hass P, Soll D, Van Embden J. Ocurrence and stability of insertion sequences in Mycobacterium tuberculosis complex strains: evaluation of an insertion sequence-dependent DNA polymorphism as a tool in the epidemiology of tuberculosis. J. Clin. Microbiol. 1991; 29: 2578-2586.
Kent T, Kubica GP. Public Health Mycobacteriology. A guide for the level III laboratory. Atlanta: U.S. Department of Health, and Human Services, Centre for Disease Control; 1985. pp. 71-120.
Canetti G, Rist N, Grosset J. Mesure de la sensibilité du bacille tuberculeux aux drogues antibacillaires pour le méthode des proportions. Rev Tuber (Paris). 1963; 27: 217-72.
Van Soolingen D, De Hass P, Kremer K. Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) typing of micobacteria. National Institute of Public Health and the Environment. Bilthoven, The Netherlands; 2002.
Niemann S, Gerdes S, Ritcher E, Thielen H, Uden H, Diel R. Stability of IS6110 restriction fragment length polymorphism patterns of Mycobacterium tuberculosis strains in actual chains of transmission. J. Clin. Microbiol. 2000; 38: 2563-2567.
Torrea G, Ofredo M, Simonet B, Gicquel P, Berche P, Audigier P. Evaluation of tuberculosis transmission in a community by 1 year of systematic typing of Mycobacterium tuberculosis clinical isolates. J. Clin. Microbiol. 1996; 34:1043-1049.
Secretaria Distrital de Salud de Bogotá. Informe Reunión Nacional de Coordinadores de PCT. Colombia; 2006.
Instituto Nacional de salud. Vigilancia de la resistencia de Mycobacterium tuberculosis a los medicamentos. Colombia 2004-2005; 2006
Quitugua T, Seaworth B, Weis S, Taylor J, Guillete J, Rosas I, et al. Transmission of Drug-Resistat Tuberculosis in Texas and Mexico. J Clin Microbiol. 2002 ; 40:2716-2724.
Gutierrez M, Vincent V, Bizet A, Gaillot O, Lebrun L, Pendeven C, et al. Molecular Fingerprinting of mycobacterium tuberculosis and Risk Factors for Tuberculosis Transmission in Paris, France, and Surrounding Area. J. Clin. Microbiol. 1998; 36: 486-492.
Rivero A, Marquez M, Santos J, Pinedo A, Sanchez MA, Esteve A, et al. High rate of tuberculosis reinfection during a nosocomial outbreak of multidrug-resistant tuberculosis caused by Mycobacterium bovis strain B. Clin Infect Dis. 2001;32(1):159-61.
Castiblanco C, Ribón W. Coinfección de tuberculosis en pacientes con VIH/SIDA: un análisis según las fuentes de información en Colombia. Infectio 2006; 10(4): 232-242.
Mistry N, Iyer A, D'souza D, Taylor G, Young D, Antia N. Spoligotyping of Mycobacterium tuberculosis Isolates from Multiple-Drug-Resistant Tuberculosis Patients from Bombay, India. J Clin Microbil. 2002; 40: 2677-2680.
Kempf M, Dunlap N, Lok K, Benjamin W, Keenan N, Kimberling M. Long-Term Molecular Analysis of Tuberculosis Strains in Alabama a State Characterized by a Largely Indigenous, Low-Risk Population. J. Clin. Microbiol. 2005; 43: 870-878.
Como Citar
APA
ACM
ACS
ABNT
Chicago
Harvard
IEEE
MLA
Turabian
Vancouver
Baixar Citação
Acessos à página de resumo
Downloads
Licença
![Creative Commons License](http://i.creativecommons.org/l/by/4.0/88x31.png)
Este trabalho está licenciado sob uma licença Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Esta revista provee acceso libre inmediato a su contenido bajo el principio de que hacer disponible gratuitamente investigación al publico apoya a un mayor intercambio de conocimiento global.
Todos los contenidos de esta revista, excepto dónde está identificado, están publicados bajo una Licencia Creative Commons Atribución 4.0.