Publicado

2025-07-01

ANÁLISIS COMPARATIVO DE LAS PROPIEDADES ESTRUCTURALES DE UNA MICELA DE SDS EN AGUA Y SU INTERACCIÓN CON EL SOLVENTE USANDO LOS MODELOS CHARMM36/TIP3P Y GROMOS53A6/SPC

A COMPARATIVE ANALYSIS OF THE STRUCTURAL PROPERTIES OF A SDS MICELLE IN WATER AND ITS INTERACTION WITH THE SOLVENT USING THE CHARMM36/TIP3P AND GOMOS53A6/SPC MODELS

DOI:

https://doi.org/10.15446/rev.fac.cienc.v14n2.118745

Palabras clave:

Campos de Fuerza, Dinámica Molecular, Micela, Surfactante (es)
Force Fields, Molecular Dynamics, Micelle, Surfactant (en)

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Autores/as

Se evaluaron las propiedades estructurales y dinámicas de una micela de dodecil sulfato de sodio (SDS) en agua mediante simulaciones de dinámica molecular con dos combinaciones de campos de fuerza: CHARMM36/TIP3P y GROMOS53A6/SPC. Se determinaron las propiedades como el radio de giro, la superficie accesible al solvente, la energía libre de solvatación y las interacciones moleculares entre la parte hidrófila y el agua. Los resultados muestran que la combinación de modelos CHARMM36/TIP3P predice un mayor número de enlaces de hidrógeno y una interacción más fuerte entre el grupo sulfato y el agua, mientras que GROMOS53A6/SPC estima una mayor energía de solvatación, lo que indica una alta afinidad de la micela por el agua. Ambos campos de fuerza describen adecuadamente el sistema micelar; sin embargo, los modelos CHARMM36/TIP3P combinados ofrecen una mayor precisión en la descripción de las interacciones moleculares.

The structural and dynamic properties of a sodium dodecyl sulfate (SDS) micelle in water were evaluated using molecular dynamics simulations with two force field combinations: CHARMM36/TIP3P and GROMOS53A6/SPC. Properties such as radius of gyration, solvent accessible surface area, solvation free energy and molecular interactions between the hydrophilic part and water were determined. The results show that the CHARMM36/TIP3P model combination predicts a higher number of hydrogen bonds and a stronger interaction between the sulfate group and water, while GROMOS53A6/SPC estimates a higher solvation energy, indicating a high affinity of the micelle for water. Both these force fields appropriately describe the micellar system; however, the combined CHARMM36/TIP3P models provide greater accuracy in describing the molecular interactions.

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Parra, J. G., Roldan, A., Rodriguez, G., Alcalá, J. A. & Iza, P. (2025). ANÁLISIS COMPARATIVO DE LAS PROPIEDADES ESTRUCTURALES DE UNA MICELA DE SDS EN AGUA Y SU INTERACCIÓN CON EL SOLVENTE USANDO LOS MODELOS CHARMM36/TIP3P Y GROMOS53A6/SPC. Revista de la Facultad de Ciencias, 14(2), 126–147. https://doi.org/10.15446/rev.fac.cienc.v14n2.118745

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Parra, J.G., Roldan, A., Rodriguez, G., Alcalá, J.A. y Iza, P. 2025. ANÁLISIS COMPARATIVO DE LAS PROPIEDADES ESTRUCTURALES DE UNA MICELA DE SDS EN AGUA Y SU INTERACCIÓN CON EL SOLVENTE USANDO LOS MODELOS CHARMM36/TIP3P Y GROMOS53A6/SPC. Revista de la Facultad de Ciencias. 14, 2 (jul. 2025), 126–147. DOI:https://doi.org/10.15446/rev.fac.cienc.v14n2.118745.

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Parra, J. G.; Roldan, A.; Rodriguez, G.; Alcalá, J. A.; Iza, P. ANÁLISIS COMPARATIVO DE LAS PROPIEDADES ESTRUCTURALES DE UNA MICELA DE SDS EN AGUA Y SU INTERACCIÓN CON EL SOLVENTE USANDO LOS MODELOS CHARMM36/TIP3P Y GROMOS53A6/SPC. Rev. Fac. Cienc. 2025, 14, 126-147.

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PARRA, J. G.; ROLDAN, A.; RODRIGUEZ, G.; ALCALÁ, J. A.; IZA, P. ANÁLISIS COMPARATIVO DE LAS PROPIEDADES ESTRUCTURALES DE UNA MICELA DE SDS EN AGUA Y SU INTERACCIÓN CON EL SOLVENTE USANDO LOS MODELOS CHARMM36/TIP3P Y GROMOS53A6/SPC. Revista de la Facultad de Ciencias, [S. l.], v. 14, n. 2, p. 126–147, 2025. DOI: 10.15446/rev.fac.cienc.v14n2.118745. Disponível em: https://revistas.unal.edu.co/index.php/rfc/article/view/118745. Acesso em: 18 nov. 2025.

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Parra, José G., Angelesmary Roldan, Geraldine Rodriguez, José A. Alcalá, y Peter Iza. 2025. «ANÁLISIS COMPARATIVO DE LAS PROPIEDADES ESTRUCTURALES DE UNA MICELA DE SDS EN AGUA Y SU INTERACCIÓN CON EL SOLVENTE USANDO LOS MODELOS CHARMM36/TIP3P Y GROMOS53A6/SPC». Revista De La Facultad De Ciencias 14 (2):126-47. https://doi.org/10.15446/rev.fac.cienc.v14n2.118745.

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Parra, J. G., A. Roldan, G. Rodriguez, J. A. Alcalá, y P. Iza. «ANÁLISIS COMPARATIVO DE LAS PROPIEDADES ESTRUCTURALES DE UNA MICELA DE SDS EN AGUA Y SU INTERACCIÓN CON EL SOLVENTE USANDO LOS MODELOS CHARMM36/TIP3P Y GROMOS53A6/SPC». Revista de la Facultad de Ciencias, vol. 14, n.º 2, julio de 2025, pp. 126-47, doi:10.15446/rev.fac.cienc.v14n2.118745.

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Parra, José G., Angelesmary Roldan, Geraldine Rodriguez, José A. Alcalá, y Peter Iza. «ANÁLISIS COMPARATIVO DE LAS PROPIEDADES ESTRUCTURALES DE UNA MICELA DE SDS EN AGUA Y SU INTERACCIÓN CON EL SOLVENTE USANDO LOS MODELOS CHARMM36/TIP3P Y GROMOS53A6/SPC». Revista de la Facultad de Ciencias 14, no. 2 (julio 1, 2025): 126–147. Accedido noviembre 18, 2025. https://revistas.unal.edu.co/index.php/rfc/article/view/118745.

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Parra JG, Roldan A, Rodriguez G, Alcalá JA, Iza P. ANÁLISIS COMPARATIVO DE LAS PROPIEDADES ESTRUCTURALES DE UNA MICELA DE SDS EN AGUA Y SU INTERACCIÓN CON EL SOLVENTE USANDO LOS MODELOS CHARMM36/TIP3P Y GROMOS53A6/SPC. Rev. Fac. Cienc. [Internet]. 1 de julio de 2025 [citado 18 de noviembre de 2025];14(2):126-47. Disponible en: https://revistas.unal.edu.co/index.php/rfc/article/view/118745

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