Abundancia y diversidad de las comunidades de Streptomyces en seis coberturas vegetales de la franja cafetera del Quindío, Colombia

Abundance and diversity of Streptomycescommunities on six land covertypes of the coffee belt in Quindío, Colombia

Seis coberturas vegetales de la franja cafetera del Quindío, en Colombia, fueron seleccionadas para un estudio comparativo de la estructura comunitaria del género Streptomyces. Mediante un recuento en placa se estimó la abundancia y diversidad morfotípica, y a partir de un análisis de PCR-RFLP del marcador rRNA 16S se estimó la diversidad genética entre los morfotipos. El mismo análisis genético se usó en muestras de DNA comunitario lo que facilita el estudio de la fracción complementaria no cultivable. Se encontraron diferencias estadísticamente significativas en la abundancia de Streptomyces entre las seis coberturas vegetales. Se obtuvieron valores de diversidad morfotípica similares en las seis coberturas, presentándose los valores más altos en guaduales y pasturas. No se encontró correspondencia entre la diversidad morfotípica y genética, con excepción de lo observado en cafetales con guamo y plátano. En el aná-lisis genético cultivo-independiente se observó un patrón específico para cada cobertura, siendo el valor más alto el de la cobertura bosque. Los resultados demuestran que la estructura de la comunidad de Streptomyces es dependiente de la cobertura vegetal, en cuanto a los parámetros de diversidad y abundancia estudiados.

Community structure of the Streptomycesgenus was compare for six land cover types ofthe coffee belt in Quindío (Central Cordillera, Colombian Andes). A plate counting method was used to estimate abundance and morphotypic diversity. Genetic diversity was studied by PCR-RFLP of ribosomal 16S genes. Likewise, ribosomal restriction analysis was used to determine genetic diversity from soil sample DNA community, including the non-cultivable fraction of the community. The analysis showed significant statistical differences on the abundance of Streptomycesamong the six cover types. Similar values of morphotypic diversity were obtained for the six cover types, having “guaduales” and pasture the highest values. It was found that genetic and morphological diversity were dissimilar, except for coffee shaded by banana and Inga. In the culture-independent analysis each cover type was characterized by specificRFLP pattern, the forest cover type presented the highest diversity. The results show that modifications in the cover type exert an influence on Streptomyces soil communities resulting in abundance and diversity variations.