Published

2019-05-01

Design of expression cassettes using the Cry1Ba1 gene for potato (Solanum tuberosum L.) varieties

Diseño de casetes de expresión para variedades de papa (Solanum tuberosum L.), basados en el gen Cry1Ba1

DOI:

https://doi.org/10.15446/agron.colomb.v37n2.70796

Keywords:

Bacillus thuringiensis, freedom to operate analysis, patatin promoter, Tecia solanivora (en)
Bacillus thuringiensis, análisis de libertad de operación, promotor de patatina, Tecia solanivora (es)

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Authors

  • Natalyth Erira Universidad Nacional de Colombia - Plant Genetic Engineering Group
  • Alejandro Chaparro-Giraldo Universidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá - Facultad de Ciencias - Departamento de Biología https://orcid.org/0000-0003-4999-8804
  • Silvio López-Pazos Universidad Antonio Nariño

The most serious insect pest problem in the potato crop in Colombia is the lepidopteran Tecia solanivora that causes
significant economic losses. In this research, we designed
expression cassettes based on the cry1Ba1 gene of Bacillus
thuringiensis that could confer resistance to T. solanivora via the variety Pastusa Suprema. We selected the elements of the
designed expression cassettes through an analysis of scientific
literature and patent databases; the considered factors were the
proteolytic activation of the Cry1Ba1 protoxin, modification of
codonic use, polyadenylation signals, and cryptic splicing sites. We used a tissue-specific patatine promoter to reduce potential
biosafety risks, because it is expressed only in the tuber. The
freedom to operate analysis suggests that the commercial use of the designed expression cassettes in transgenic potato plants does not affect the rights of third parties in Colombia.

El más grave problema de insectos plaga en el cultivo de la papa en Colombia, es el lepidóptero Tecia solanivora, que causa
importantes pérdidas económicas. En este trabajo se diseñaron
casetes de expresión basados en el gen cry1Ba1 de Bacillus
thuringiensis que pudiesen conferir resistencia a T. solanivora para la variedad Pastusa Suprema. Los elementos de los casetes de expresión diseñados fueron seleccionados mediante un análisis de literatura científica y de bases de datos de patentes;
se tuvieron en cuenta los siguientes factores: activación proteolítica de la protoxina Cry1Ba1, modificación de uso codónico, señales de poliadenilación y sitios crípticos de splicing. Se usó un promotor tejido específico de patatina que puede disminuir potenciales riesgos de bioseguridad, debido a que se expresa solo en el tubérculo. El análisis de libertad de operación sugiere que el uso comercial de los casetes de expresión diseñados en plantas transgénicas de papa no afecta los derechos de terceros en el territorio de Colombia.

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APA

Erira, N., Chaparro-Giraldo, A. and López-Pazos, S. (2019). Design of expression cassettes using the Cry1Ba1 gene for potato (Solanum tuberosum L.) varieties. Agronomía Colombiana, 37(2), 103–111. https://doi.org/10.15446/agron.colomb.v37n2.70796

ACM

[1]
Erira, N., Chaparro-Giraldo, A. and López-Pazos, S. 2019. Design of expression cassettes using the Cry1Ba1 gene for potato (Solanum tuberosum L.) varieties. Agronomía Colombiana. 37, 2 (May 2019), 103–111. DOI:https://doi.org/10.15446/agron.colomb.v37n2.70796.

ACS

(1)
Erira, N.; Chaparro-Giraldo, A.; López-Pazos, S. Design of expression cassettes using the Cry1Ba1 gene for potato (Solanum tuberosum L.) varieties. Agron. Colomb. 2019, 37, 103-111.

ABNT

ERIRA, N.; CHAPARRO-GIRALDO, A.; LÓPEZ-PAZOS, S. Design of expression cassettes using the Cry1Ba1 gene for potato (Solanum tuberosum L.) varieties. Agronomía Colombiana, [S. l.], v. 37, n. 2, p. 103–111, 2019. DOI: 10.15446/agron.colomb.v37n2.70796. Disponível em: https://revistas.unal.edu.co/index.php/agrocol/article/view/70796. Acesso em: 25 apr. 2024.

Chicago

Erira, Natalyth, Alejandro Chaparro-Giraldo, and Silvio López-Pazos. 2019. “Design of expression cassettes using the Cry1Ba1 gene for potato (Solanum tuberosum L.) varieties”. Agronomía Colombiana 37 (2):103-11. https://doi.org/10.15446/agron.colomb.v37n2.70796.

Harvard

Erira, N., Chaparro-Giraldo, A. and López-Pazos, S. (2019) “Design of expression cassettes using the Cry1Ba1 gene for potato (Solanum tuberosum L.) varieties”, Agronomía Colombiana, 37(2), pp. 103–111. doi: 10.15446/agron.colomb.v37n2.70796.

IEEE

[1]
N. Erira, A. Chaparro-Giraldo, and S. López-Pazos, “Design of expression cassettes using the Cry1Ba1 gene for potato (Solanum tuberosum L.) varieties”, Agron. Colomb., vol. 37, no. 2, pp. 103–111, May 2019.

MLA

Erira, N., A. Chaparro-Giraldo, and S. López-Pazos. “Design of expression cassettes using the Cry1Ba1 gene for potato (Solanum tuberosum L.) varieties”. Agronomía Colombiana, vol. 37, no. 2, May 2019, pp. 103-11, doi:10.15446/agron.colomb.v37n2.70796.

Turabian

Erira, Natalyth, Alejandro Chaparro-Giraldo, and Silvio López-Pazos. “Design of expression cassettes using the Cry1Ba1 gene for potato (Solanum tuberosum L.) varieties”. Agronomía Colombiana 37, no. 2 (May 1, 2019): 103–111. Accessed April 25, 2024. https://revistas.unal.edu.co/index.php/agrocol/article/view/70796.

Vancouver

1.
Erira N, Chaparro-Giraldo A, López-Pazos S. Design of expression cassettes using the Cry1Ba1 gene for potato (Solanum tuberosum L.) varieties. Agron. Colomb. [Internet]. 2019 May 1 [cited 2024 Apr. 25];37(2):103-11. Available from: https://revistas.unal.edu.co/index.php/agrocol/article/view/70796

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