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Código de barras de ADN de Cattleya quadricolor, una orquídeaendémica de Colombia y amenazada de extinción
DNA barcode of Cattleya quadricolor, an orchid endemic to Colombia andthreatened with extinction
DOI:
https://doi.org/10.15446/caldasia.v48.116544Palabras clave:
Andes tropicales, BOLD Systems, Bosque Seco Tropical, Identificación molecular, Orchidaceae (es)BOLD Systems, Molecular identification, Orchidaceae, Tropical Andes, Tropical Dry Forest (en)
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Colombia es el país con mayor riqueza de orquídeas en el mundo, se registran más de 4600 especies, las cuales enfrentan graves impactos antropogénicos, entre los cuales están: transformación del hábitat, cambio climático y la continua extracción ilegal de plantas de su hábitat natural. Los códigos de barras de ADN permiten la identificación de especies a partir de datos de secuencias de ADN, con aplicación en estudios ecológicos, florísticos y forenses. Este estudio tuvo el objetivo de desarrollar el código de barras de ADN para Cattleya quadricolor, una especie endémica del bosque seco tropical de la cuenca alta del valle del río Cauca y categorizada en Peligro de Extinción (EN), para permitir su identificación molecular. Se registraron en la base de datos en línea, BOLD Systems, las secuencias de tres loci del genoma del cloroplasto e imágenes en la forma de láminas fotográficas compuestas de tres especímenes muestreados de poblaciones nativas distintas. Se analizó la diferenciación genética intra- e interespecífica, comparando esta especie con otras especies del género Cattleya. El Código de Barras de ADN de Cattleya quadricolor no muestra variación intraespecífica y proporciona una herramienta para la identificación de esta especie en estudios florísticos y ecológicos. Por los bajos niveles de variación genética interespecífica encontrados entre Cattleya quadricolor y otras especies congenéricas nativas de Colombia, se recomienda evaluar la diversidad a través del plastoma para esclarecer las identidades genéticas interespecíficas de las especies de Cattleya nativas a Colombia.
Colombia has the greatest orchid richness, with more than 4 600 species. Orchids face grave threats from habitat transformation, climate change and ongoing illegal extraction of plants from their natural habitat. DNA Barcode offers a means to identify species from DNA sequences, with application in ecological, floristic and forensic studies. In this study we aimed to develop the DNA Barcode for Cattleya quadricolor an endemic, Endangered (EN) species, to the tropical dry forest of the upper valley of the Cauca River, to facilitate molecular identification. DNA sequence data for three loci from the chloroplast genome and images in the form of composite photographic plates for three specimens collected from different populations were registered in the BOLD Systems platform. Intra- and inter-specific levels of genetic differentiation were evaluated, with comparison to other species in the genus Cattleya. The DNA barcode for this species shows no genetic intraspecific variation and provides a tool for species identification in floristic and ecological studies in its threatened native ecosystem. Due to low levels of interspecific variation found between Cattleya quadricolor and congeneric species native to Colombia, we recommend an evaluation using plastome-wide genetic markers to elucidate interspecific genetic relationships between the species of Cattleya native to Colombia.
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