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Detección molecular de virus en cultivos de uchuva (Physalis peruviana) del suroeste de Antioquia (Colombia)
Molecular detection of viruses in Cape gooseberry (Physalis peruviana) crops from Southwestern Antioquia (Colombia)
DOI:
https://doi.org/10.15446/acag.v71n1.99453Palabras clave:
certificación de semilla, fitopatología, PCR en tiempo real, Solanaceae, virus de plantas (es)seed certification, phytopathology, real time PCR, Solanaceae, plant viruses (en)
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La uchuva es una de las frutas promisorias para la zona andina de Colombia gracias a su alta demanda internacional. En Antioquia, su siembra se concentra en el oriente, aunque otras subregiones como el norte y suroeste presentan condiciones óptimas para su cultivo. Ya que las enfermedades de origen viral son uno de los problemas emergentes de este frutal, en este estudio se evaluó la infección de virus de RNA que infectan los cultivos de uchuva en el suroeste de Antioquia. Para esto se utilizaron pruebas de RT-qPCR en muestras foliares de plantas sintomáticas y asintomáticas obtenidas en ocho lotes, así como en ocho muestras de semillas extraídas de frutos comercializados en esta subregión. Los resultados indicaron la presencia en al menos una muestra foliar de los virus PVY, PVX, PVS, CGIV-1 y PMTV, mientras que PVV, PYVV y PhyVNV no fueron detectados. El PMTV (75 %) y el PVX (62.5 %) fueron los virus que presentaron mayores niveles de prevalencia en muestras sintomáticas y asintomáticas, respectivamente. Para el caso de las semillas, se encontró la infección de los virus PVX (87.5 %), PVS (75 %), PVY (37.5 %), PhyVNV (12.5 %) y CGIV-1 (12.5 %). Adicionalmente, mediante análisis de NGS se detectó la presencia de secuencias de los virus CMV, PhyVNV, PVS, y TaLMV. Estos hallazgos señalan la necesidad de establecer en el país programas de monitoreo de virus en cultivos de uchuva y de certificación de semilla.
Cape gooseberry is one of the most promising fruit crops in the Colombian Andes because of its high demand in the international market. In the province of Antioquia, this crop is cultivated mostly in the east, but optimal conditions are also available in the northern and southwestern regions. As viral diseases have become a serious emergent threat to this crop, we have investigated the RNA virus infection in Cape gooseberry crops from southwestern Antioquia. The presence of viruses was tested by RT-qPCR of leaves of symptomatic and asymptomatic plants from eight commercial plots, and eight seed samples from commercial vendors in the region. Our results revealed the presence of PVY, PVX, PVS, CGIV-1, and PMTV in at least one sample of commercial plots; neither PVV, PYVV nor PhyVNV were detected in these samples. PMTV and PVX were the most prevalent viruses in symptomatic and asymptomatic adult plant samples with 75.0 and 62.5 %, respectively. Analysis of seeds revealed 87.5 % prevalence for PVX, 75.0 % for PVS, 37.5 % for PVY, 12.5 % for PhyVNV, and 12.5 % for CGIV-1. A next generation sequencing revealed sequence reads of CMV, PhyVNV, PVS, and TaLMV. These results highlight the need to implement surveillance programs that monitor the health status of commercial plots, and to get certified seed of P. peruviana.
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