Publicado

2016-01-01

Caracterización molecular de Colletotrichum gloeosporioides aislado de plantas de ñame de la Costa Atlántica Colombiana utilizando la técnica “DNA Amplification Fingerprinting (DAF)”

Molecular characterization of Colletotrichum gloeosporioides isolated from yam plants of Colombia Atlantic Coast using DNA Amplification Fingerprinting technique (DAF)

DOI:

https://doi.org/10.15446/rev.colomb.biote.v18n1.57720

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Autores/as

  • Natalia Giraldo Marroquín Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional de Colombia, Sede Bogotá
  • Silvia Lizette Bustamante Rodríguez Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional de Colombia, Sede Bogotá
  • Yeimy Alexandra Pinzón Gutiérrez Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional de Colombia, Sede Bogotá
  • Gustavo Buitrago Hurtado Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional de Colombia, Sede Bogotá
La antracnosis en ñame, causada por el hongo Colletotrichum gloeosporioides, es una enfermedad relevante que posee el potencial de destruir el 100% de la cosecha, convirtiéndose en la principal limitante fitosanitaria para el rendimiento del cultivo en el país. Esta es una situación preocupante considerando que aproximadamente 35.000 familias de pequeños y medianos agricultores de la Costa Atlántica Colombiana subsisten de este cultivo; es por esto que el objetivo de este trabajo fue caracterizar molecularmente 42 aislamientos del hongo procedentes de plantas de ñame con síntomas de la enfermedad, utilizando la técnica molecular “DNA Amplification Fingerprinting (DAF)”, caracterizada por su resolución en la determinación de la variabilidad genética de diferentes organismos. Para la determinación de polimorfismos, se amplificaron 16 marcadores DAF implementando iniciadores tipo decámero, los cuales fueron visualizados por electroforesis en microchip con el equipo MCE-202 MultiNA. Se evaluó la reproducibilidad de la técnica DAF. La amplificación arrojó 391 bandas inequívocamente polimórficas en todas las muestras, el coeficiente de Dice identificó cinco grupos con 0.30% de similaridad y el índice de diversidad genética fue de 0.28; datos que reflejan un alto grado de variabilidad en la colección estudiada de C. gloeosporioides. Ésta puede deberse, al intercambio de germoplasma, a su condición heterotálica, a las mutaciones y al alto potencial de dispersión de las conidias que le permiten mantener la viabilidad bajo condiciones adversas. Por último, se encontró que DAF es una técnica reproducible, confirmando que es una metodología fiable para la caracterización molecular de hongos.

Yam anthracnose, caused by the fungus Colletotrichum gloeosporioides, is a significant disease that has the potential to destroy harvests in 100%, causing the decrease in crop yields nationally. Consequently, its situation affects approximately 35.000 families of small farmers the Atlantic Coast for whom it is the livelihoods. Due to above, the objective of this work was to perform the molecular characterize of 42 C. gloeosporioides isolates from yam plants with symptoms of the disease, using the molecular technique "DNA Amplification Fingerprinting (DAF)" useful for its resolution in determining the genetic variability of different organisms. For polymorphisms determination, were amplified 16 DAF markers by using primers decamers type, the banding patron was visualized by electrophoresis in microchip 202 MCE-MultiNA equipment also, we assessed of DAF technique reproducibility. The amplification process yielded 391 unequivocally polymorphic bands in all samples, Through Dice coefficient we identified five groups with 0.30% of similarity and a genetic diversity index of 0.28. Our data show a high degree of variability in the collection of C. gloeosporioides studied. The high variability could be due to several reasons like germplasm exchanges, the heterothallic condition of fungal isolates, a presence of mutations and the high potential for conidia dispersal that allow it to maintain its viability under adverse conditions. Finally, we found that DAF technique is reproducible, confirming that it is a reliable methodology for the fungi molecular characterization.

Key words: anthracnose, necrosis, genetic diversity, DNA, fungi.

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Caracterización molecular de Colletotrichum gloeosporioides aislado de plantas de ñame de la Costa Atlántica Colombiana utilizando la técnica “DNA Amplification Fingerprinting (DAF)”. (2016). Revista Colombiana De Biotecnología, 18(1), 95-103. https://doi.org/10.15446/rev.colomb.biote.v18n1.57720

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