Publicado

2023-12-12

Evaluación y detección bioinformática de terpenoides con potencial inhibitorio de la proteína viral 1 (VP1) del virus de la bursitis infecciosa

Evaluation and bioinformatic detection of terpenoids with inhibitory potential of viral protein 1 (VP1) of infectious bursitis virus

DOI:

https://doi.org/10.15446/rfmvz.v70n3.106011

Palabras clave:

Bursitis, ARN polimerasa, terpenos, Gumboro (es)
bursitis, RNA polymerase, terpenes, Gumboro (en)

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El virus de la bursitis infecciosa (IBDV) es el agente causal de la enfermedad de la bursa, la cual afecta principalmente a poblaciones avícolas jóvenes y genera un impacto económico negativo en la producción. La proteína vira 1 (VP1) es una enzima con funciones clave para la replicación del genoma viral, por lo que puede ser considerada blanco para la búsqueda de compuestos con posibles actividades inhibitorias. El objetivo de esta investigación fue evaluar terpenoides con potencial inhibitorio de la proteína VP1 del IBDV mediante herramientas de aproximaciones bioinformáticas. Se seleccionó un total de 52 terpenoides, cuyas propiedades farmacológicas, farmacocinéticas y tóxicas (ADME-Tox) se evaluaron. Las moléculas sin actividades tóxicas y con aptitudes farmacocinéticas fueron sometidas a pruebas exhaustivas de acoplamiento molecular con el sitio catalítico de la VP1 mediante el uso del algoritmo genético y de Broyden-Fletcher-Goldfarb-Shanno junto con el método de optimización local de gradientes. Los datos obtenidos revelaron que la Giberelina A1 presenta valores de energía libre de unión significativamente (P < 0,05) favorables (ΔG=-7,28±0,06 kcal/mol; Kdcalc= 8,62±0,99 μM) en comparación con los sustratos rCTP y rGTP. El complejo Giberelina A1-VP1 presenta puentes de hidrógeno con los residuos Arg335 y Asp402, los cuales cumplen roles importantes en la actividad catalítica en la replicación viral. Estos hallazgos sugieren que el terpenoide Giberelina A1 puede ser considerado como compuesto candidato para estudios in vitro de inhibición de funciones de la VP1 e in vivo de actividades antivirales contra el virus de la bursitis infecciosa.

Infectious bursitis virus (IBDV) is the infectious agent of bursal disease, which mainly affects young poultry populations, generating a negative economic impact on productions. The viral protein 1 (VP1) is an enzyme with important functions for the replication of the viral genome, so it could be considered as a target for searching compounds with possible inhibitory activities. The aim of this research was to evaluate terpenoids with inhibitory potential of the VP1 protein of IBDV using computational approximations tools. A total of 52 terpenoids were selected and evaluated for their pharmacological, pharmacokinetic and toxic properties (ADME-Tox). Molecules without toxic activities and with pharmacokinetic competences were subjected to extensive molecular docking tests with the catalytic site of VP1 using the genetic and Broyden-Fletcher-Goldfarb-Shanno algorithms with a local gradient optimization method. Data obtained revealed that Gibberellin A1 exhibits significantly (P < 0.05) favorable binding free energy values (ΔG=-7.28±0.06 kcal/mol; Kdcalc= 8.62±0.99 μM) compared to rCTP and rGTP substrates. The Gibberellin A1-VP1 complex exhibits hydrogen bonds with residues Arg335 and Asp402, which play important roles in catalytic activity in viral replication. These findings suggest that the terpenoid Gibberellin A1 could be considered as a candidate compound for in vitro studies of inhibition of VP1 functions and in vivo antiviral activities against infectious bursitis virus.

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Gayozo, E. y Arce, C. D. J. (2023). Evaluación y detección bioinformática de terpenoides con potencial inhibitorio de la proteína viral 1 (VP1) del virus de la bursitis infecciosa. Revista de la Facultad de Medicina Veterinaria y de Zootecnia, 70(3), e106011. https://doi.org/10.15446/rfmvz.v70n3.106011

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Gayozo, E. y Arce, C.D.J. 2023. Evaluación y detección bioinformática de terpenoides con potencial inhibitorio de la proteína viral 1 (VP1) del virus de la bursitis infecciosa. Revista de la Facultad de Medicina Veterinaria y de Zootecnia. 70, 3 (dic. 2023), e106011. DOI:https://doi.org/10.15446/rfmvz.v70n3.106011.

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(1)
Gayozo, E.; Arce, C. D. J. Evaluación y detección bioinformática de terpenoides con potencial inhibitorio de la proteína viral 1 (VP1) del virus de la bursitis infecciosa. Rev. Med. Vet. Zoot. 2023, 70, e106011.

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GAYOZO, E.; ARCE, C. D. J. Evaluación y detección bioinformática de terpenoides con potencial inhibitorio de la proteína viral 1 (VP1) del virus de la bursitis infecciosa. Revista de la Facultad de Medicina Veterinaria y de Zootecnia, [S. l.], v. 70, n. 3, p. e106011, 2023. DOI: 10.15446/rfmvz.v70n3.106011. Disponível em: https://revistas.unal.edu.co/index.php/remevez/article/view/106011. Acesso em: 11 ago. 2024.

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Gayozo, E., y C. D. J. Arce. 2023. «Evaluación y detección bioinformática de terpenoides con potencial inhibitorio de la proteína viral 1 (VP1) del virus de la bursitis infecciosa». Revista De La Facultad De Medicina Veterinaria Y De Zootecnia 70 (3):e106011. https://doi.org/10.15446/rfmvz.v70n3.106011.

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Gayozo, E. y Arce, C. D. J. (2023) «Evaluación y detección bioinformática de terpenoides con potencial inhibitorio de la proteína viral 1 (VP1) del virus de la bursitis infecciosa», Revista de la Facultad de Medicina Veterinaria y de Zootecnia, 70(3), p. e106011. doi: 10.15446/rfmvz.v70n3.106011.

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E. Gayozo y C. D. J. Arce, «Evaluación y detección bioinformática de terpenoides con potencial inhibitorio de la proteína viral 1 (VP1) del virus de la bursitis infecciosa», Rev. Med. Vet. Zoot., vol. 70, n.º 3, p. e106011, dic. 2023.

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Gayozo, E., y C. D. J. Arce. «Evaluación y detección bioinformática de terpenoides con potencial inhibitorio de la proteína viral 1 (VP1) del virus de la bursitis infecciosa». Revista de la Facultad de Medicina Veterinaria y de Zootecnia, vol. 70, n.º 3, diciembre de 2023, p. e106011, doi:10.15446/rfmvz.v70n3.106011.

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Gayozo, E., y C. D. J. Arce. «Evaluación y detección bioinformática de terpenoides con potencial inhibitorio de la proteína viral 1 (VP1) del virus de la bursitis infecciosa». Revista de la Facultad de Medicina Veterinaria y de Zootecnia 70, no. 3 (diciembre 12, 2023): e106011. Accedido agosto 11, 2024. https://revistas.unal.edu.co/index.php/remevez/article/view/106011.

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Gayozo E, Arce CDJ. Evaluación y detección bioinformática de terpenoides con potencial inhibitorio de la proteína viral 1 (VP1) del virus de la bursitis infecciosa. Rev. Med. Vet. Zoot. [Internet]. 12 de diciembre de 2023 [citado 11 de agosto de 2024];70(3):e106011. Disponible en: https://revistas.unal.edu.co/index.php/remevez/article/view/106011

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