Publicado

2004-01-01

Estandarización y evaluación de tres sistemas de rep-PCR para la tipificación de Klebsiella pneumoniae

Standardization and evaluation of three rep-PCR systems for typefication of Klebsiella pneumoniae

Palabras clave:

Klebsiella pneumoniae, PFGE, rep-PCR, genotipificación. (es)
Klebsiella pneumoniae, PFGE, rep-PCR, genotyping (en)

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Autores/as

  • Jose Ramón Mantilla
  • Ibonne Garcia
  • Paula Andrea Espinal
  • Emilia Maria Valenzuela

Para la tipificación de K. pneumoniae se evaluaron los resultados de tres variantes de la técnica de amplificación de secuencias repetidas (rep-PCR) comparándolos con los resultados de la tipificación con electroforesis en gel de campos pulsados (PFGE). Se analizaron dos poblaciones de K. pneumoniae: una constituida por aislamientos causantes de infección nosocomial, recolectados durante un año en un hospital de tercer nivel y otra asociada a un brote intrahospitalario en una unidad de cuidado intensivo neonatal. La tipificación por PFGE se realizó con macrofragmentos obtenidos con Xbal. La rep-PCR se realizó con tres conjuntos de iniciadores correspondientes a las secuencias, BOX, ERIC y REP. Todos los aislamientos fueron tipificables por los tres sistemas rep-PCR y fueron discriminados de manera similar a lo obtenido con PFGE (D = 0.978). El buen poder discriminatorio (D = 0.974) obtenido con los procedimientos rep-PCR estandarizados permite sugerir el empleo de REP-PCR y BOX-PCR para tipificación rápida de aislamientos de K. pneumoniae, aplicada a estudios de epidemiología molecular de la infección nosocomial.

The results of three variations of the repeated sequence (rep-PCR) amplification technique for typing K. pneumoniae were evaluated by comparing them with the results of pulsed field gel electrophoresis (PFGE) typing. Two K. pneumoniae populations were analysed; one was constituted by isolates causing nosocomial infection, collected throughout a year from a third-level hospital and the other was associated with an intra-hospital outbreak in a neonatal intensive-care unit. PFGE typing was done with macro-fragments obtained with XbaI. Rep-PCR was done with three sets of primers corresponding to BOX, ERIC and REP sequences. All isolates were typable by all three rep-PCR systems and were discriminated similarly to results obtained with PFGE (D = 0.978). The good discriminatory power (D = 0.974) obtained with standardised rep-PCR procedures leads to the suggestion that using REP-PCR and BOX-PCR for rapid typing of K. pneumoniae isolates can be applied to molecular epidemiology studies of nosocomial infection.

Cómo citar

APA

Mantilla, J. R., Garcia, I., Espinal, P. A. y Valenzuela, E. M. (2004). Estandarización y evaluación de tres sistemas de rep-PCR para la tipificación de Klebsiella pneumoniae. Revista Colombiana de Ciencias Químico-Farmacéuticas, 33(1). https://revistas.unal.edu.co/index.php/rccquifa/article/view/1662

ACM

[1]
Mantilla, J.R., Garcia, I., Espinal, P.A. y Valenzuela, E.M. 2004. Estandarización y evaluación de tres sistemas de rep-PCR para la tipificación de Klebsiella pneumoniae. Revista Colombiana de Ciencias Químico-Farmacéuticas. 33, 1 (ene. 2004).

ACS

(1)
Mantilla, J. R.; Garcia, I.; Espinal, P. A.; Valenzuela, E. M. Estandarización y evaluación de tres sistemas de rep-PCR para la tipificación de Klebsiella pneumoniae. Rev. Colomb. Cienc. Quím. Farm. 2004, 33.

ABNT

MANTILLA, J. R.; GARCIA, I.; ESPINAL, P. A.; VALENZUELA, E. M. Estandarización y evaluación de tres sistemas de rep-PCR para la tipificación de Klebsiella pneumoniae. Revista Colombiana de Ciencias Químico-Farmacéuticas, [S. l.], v. 33, n. 1, 2004. Disponível em: https://revistas.unal.edu.co/index.php/rccquifa/article/view/1662. Acesso em: 28 mar. 2024.

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Mantilla, Jose Ramón, Ibonne Garcia, Paula Andrea Espinal, y Emilia Maria Valenzuela. 2004. «Estandarización y evaluación de tres sistemas de rep-PCR para la tipificación de Klebsiella pneumoniae». Revista Colombiana De Ciencias Químico-Farmacéuticas 33 (1). https://revistas.unal.edu.co/index.php/rccquifa/article/view/1662.

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Mantilla, J. R., Garcia, I., Espinal, P. A. y Valenzuela, E. M. (2004) «Estandarización y evaluación de tres sistemas de rep-PCR para la tipificación de Klebsiella pneumoniae», Revista Colombiana de Ciencias Químico-Farmacéuticas, 33(1). Disponible en: https://revistas.unal.edu.co/index.php/rccquifa/article/view/1662 (Accedido: 28 marzo 2024).

IEEE

[1]
J. R. Mantilla, I. Garcia, P. A. Espinal, y E. M. Valenzuela, «Estandarización y evaluación de tres sistemas de rep-PCR para la tipificación de Klebsiella pneumoniae», Rev. Colomb. Cienc. Quím. Farm., vol. 33, n.º 1, ene. 2004.

MLA

Mantilla, J. R., I. Garcia, P. A. Espinal, y E. M. Valenzuela. «Estandarización y evaluación de tres sistemas de rep-PCR para la tipificación de Klebsiella pneumoniae». Revista Colombiana de Ciencias Químico-Farmacéuticas, vol. 33, n.º 1, enero de 2004, https://revistas.unal.edu.co/index.php/rccquifa/article/view/1662.

Turabian

Mantilla, Jose Ramón, Ibonne Garcia, Paula Andrea Espinal, y Emilia Maria Valenzuela. «Estandarización y evaluación de tres sistemas de rep-PCR para la tipificación de Klebsiella pneumoniae». Revista Colombiana de Ciencias Químico-Farmacéuticas 33, no. 1 (enero 1, 2004). Accedido marzo 28, 2024. https://revistas.unal.edu.co/index.php/rccquifa/article/view/1662.

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1.
Mantilla JR, Garcia I, Espinal PA, Valenzuela EM. Estandarización y evaluación de tres sistemas de rep-PCR para la tipificación de Klebsiella pneumoniae. Rev. Colomb. Cienc. Quím. Farm. [Internet]. 1 de enero de 2004 [citado 28 de marzo de 2024];33(1). Disponible en: https://revistas.unal.edu.co/index.php/rccquifa/article/view/1662

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