Caracterización de cepas nativas colombianas de Clostridios solventogénicos por perfiles de plásmidos

Characterization of native strains of solventogenic Clostridia from plasmid profiles

Este trabajo tuvo como objetivo caracterizar molecularmente trece cepas nativas de Clostridium solventogénicos aislados en suelos colombianos, con el propósito de establecer diferencias a través de sus perfiles plasmídicos. Se estandarizaron las condiciones para la extracción de plásmidos en estos microorganismos anaeróbicos y las condiciones para la digestión con enzimas de restricción. Todas las cepas nativas alojan al menos un plásmido que migra entre 20 y 34 kpb y 7 de ellas poseen un plásmido más, que migra entre 11 y 14 kpb. Los perfiles plasmídicos obtenidos con las enzimas empleadas fueron muy homogéneos y no permitieron diferenciar las cepas, lo cual muestra que estos marcadores moleculares no tienen poder discriminatorio para el estudio de los Clostridios.

The objective of this work was the molecular characterisation of thirteen native Clostridium strains isolated from Colombian soils, with the purpose to establish differences between theirs plasmids profiles. A total plasmid extraction protocol was standardised for these anaerobic microorganisms during molecular characterisation and the conditions for endonucleases digestion also were standardised. A plasmid (molecular size between 20 and 34 kbp) was found in all of them. 7 possessed an extra plasmid ranging in size between 11 and 14 kbp. The plasmids profiles obtained with the endonucleases were very homogeneous and did not allow the differentiation between the strains.