Publicado

2018-09-01

Estudio de la expresión de genes que codifican para putativas proteínas PR en yuca (Manihot esculenta Crantz)

Studying the Expression of Genes Coding for Putative PR Proteins in Cassava (Manihot esculenta Crantz)

DOI:

https://doi.org/10.15446/abc.v23n3.70868

Palabras clave:

bacteriosis vascular, expresión génica, genes relacionados con patogenicidad, <i>Xanthomonas axonopodis</i> pv. <i>manihotis</i> (es)
cassava bacterial blight, gene expression, pathogenesis-related genes, <i>Xanthomonas axonopodis</i> pv. <i>manihotis</i> (en)

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Autores/as

  • Mariana Herrera
  • David Portillo
  • Marlon Adrian Pulido
  • Paula Alejandra Diaz Tatis Universidad Antonio Nariño
  • Camilo Ernesto López Carrascal Universidad Nacional de COlombia

Posterior al reconocimiento de agentes patógenos las plantas activan una serie de cascadas de señalización que culminan con la activación de factores de transcripción. Esto genera una concomitante reprogramación de la expresión génica que incluye la activación de la transcripción de los genes PR (relacionados con patogenicidad). Las proteínas PR son conocidas por poseer actividad antimicrobiana y evitan la posterior colonización del patógeno. En este estudio se empleó una aproximación bioinformática para identificar el repertorio de posibles proteínas PR en el genoma de yuca. Adicionalmente, se evaluó la expresión de nueve genes PR a lo largo del tiempo en variedades de yuca resistentes y susceptibles en respuesta a la inoculación con la bacteria Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam) mediante RT-PCR. Se encontró que varios genes PR fueron inducidos producto de la herida que se realiza durante el proceso de inoculación. Con el fin de evaluar cuantitativamente la contribución real de la infección bacteriana en la expresión de estos genes, se llevó a cabo una RT-PCR en tiempo real (QRT, Quantitative Real-Time PCR). Se encontró que en la variedad resistente el gen que codifica para MePR1 (Manes06G026900.1) presentó una inducción en su expresión a diferentes tiempos post-inoculación, lo cual no se observó en la variedad susceptible. De esta manera, este gen se constituye en un excelente marcador para evaluar la respuesta molecular de resistencia en plantas de yuca.

Once pathogens are perceived by plants a signal transduction pathway is activated leading to the induction of transcription factors, which in turn reprogram the host gene expression including the transcription of PR (Pathogenesis-Related) genes. The PR proteins are well known for their antimicrobial activity and for contributing to arrest the invasion of pathogens. In this work, a bioinformatics approach was used to identify the repertoire of possible PR proteins in the cassava genome. Additionally, the expression of nine PR genes was evaluated over the time course in resistant and susceptible cassava varieties in response to inoculation with the bacterium Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam) by semiquantitative RT-PCR. It was found that several PR genes were induced as a result of the wound that is made during the inoculation process. In order to evaluate quantitatively the real contribution of the bacterial infection in the expression of the genes, a Real Time RT-PCR (qRT, quantitative Real-Time PCR) was carried out. In the resistant variety the gene coding for MePR1 (Manes06G026900) showed an induction in their expression at different post-inoculation times, which was not observed in the susceptible variety. Therefore, this gene constitutes an excellent marker to evaluate the molecular resistance response in cassava plants.

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Herrera, M., Portillo, D., Pulido, M. A., Diaz Tatis, P. A. & López Carrascal, C. E. (2018). Estudio de la expresión de genes que codifican para putativas proteínas PR en yuca (Manihot esculenta Crantz). Acta Biológica Colombiana, 23(3), 242–252. https://doi.org/10.15446/abc.v23n3.70868

ACM

[1]
Herrera, M., Portillo, D., Pulido, M.A., Diaz Tatis, P.A. y López Carrascal, C.E. 2018. Estudio de la expresión de genes que codifican para putativas proteínas PR en yuca (Manihot esculenta Crantz). Acta Biológica Colombiana. 23, 3 (sep. 2018), 242–252. DOI:https://doi.org/10.15446/abc.v23n3.70868.

ACS

(1)
Herrera, M.; Portillo, D.; Pulido, M. A.; Diaz Tatis, P. A.; López Carrascal, C. E. Estudio de la expresión de genes que codifican para putativas proteínas PR en yuca (Manihot esculenta Crantz). Acta biol. Colomb. 2018, 23, 242-252.

ABNT

HERRERA, M.; PORTILLO, D.; PULIDO, M. A.; DIAZ TATIS, P. A.; LÓPEZ CARRASCAL, C. E. Estudio de la expresión de genes que codifican para putativas proteínas PR en yuca (Manihot esculenta Crantz). Acta Biológica Colombiana, [S. l.], v. 23, n. 3, p. 242–252, 2018. DOI: 10.15446/abc.v23n3.70868. Disponível em: https://revistas.unal.edu.co/index.php/actabiol/article/view/70868. Acesso em: 21 mar. 2026.

Chicago

Herrera, Mariana, David Portillo, Marlon Adrian Pulido, Paula Alejandra Diaz Tatis, y Camilo Ernesto López Carrascal. 2018. «Estudio de la expresión de genes que codifican para putativas proteínas PR en yuca (Manihot esculenta Crantz)». Acta Biológica Colombiana 23 (3):242-52. https://doi.org/10.15446/abc.v23n3.70868.

Harvard

Herrera, M., Portillo, D., Pulido, M. A., Diaz Tatis, P. A. y López Carrascal, C. E. (2018) «Estudio de la expresión de genes que codifican para putativas proteínas PR en yuca (Manihot esculenta Crantz)», Acta Biológica Colombiana, 23(3), pp. 242–252. doi: 10.15446/abc.v23n3.70868.

IEEE

[1]
M. Herrera, D. Portillo, M. A. Pulido, P. A. Diaz Tatis, y C. E. López Carrascal, «Estudio de la expresión de genes que codifican para putativas proteínas PR en yuca (Manihot esculenta Crantz)», Acta biol. Colomb., vol. 23, n.º 3, pp. 242–252, sep. 2018.

MLA

Herrera, M., D. Portillo, M. A. Pulido, P. A. Diaz Tatis, y C. E. López Carrascal. «Estudio de la expresión de genes que codifican para putativas proteínas PR en yuca (Manihot esculenta Crantz)». Acta Biológica Colombiana, vol. 23, n.º 3, septiembre de 2018, pp. 242-5, doi:10.15446/abc.v23n3.70868.

Turabian

Herrera, Mariana, David Portillo, Marlon Adrian Pulido, Paula Alejandra Diaz Tatis, y Camilo Ernesto López Carrascal. «Estudio de la expresión de genes que codifican para putativas proteínas PR en yuca (Manihot esculenta Crantz)». Acta Biológica Colombiana 23, no. 3 (septiembre 1, 2018): 242–252. Accedido marzo 21, 2026. https://revistas.unal.edu.co/index.php/actabiol/article/view/70868.

Vancouver

1.
Herrera M, Portillo D, Pulido MA, Diaz Tatis PA, López Carrascal CE. Estudio de la expresión de genes que codifican para putativas proteínas PR en yuca (Manihot esculenta Crantz). Acta biol. Colomb. [Internet]. 1 de septiembre de 2018 [citado 21 de marzo de 2026];23(3):242-5. Disponible en: https://revistas.unal.edu.co/index.php/actabiol/article/view/70868

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